春假結束上班首日，南投縣政府即召開「南投縣嚴重特殊傳染性肺炎第二次應變會議」，由副縣長陳正昇主持，除了縣府各相關單位，衛生福利部疾病管制署中區管制中心主任劉碧隆、中區傳染病防治醫療網副指揮官黃伊文、南投醫院院長洪弘昌等相關部門也都出席，共同針對防疫問題進行應變探討。
陳副縣長表示，此次疫情逐漸擴大，縣府絲毫不敢大意，要求同仁繃緊神經，確實執行各個環節的重點工作，讓疫情獲得掌控。
新型冠狀病毒感染的肺炎截至30日上午，已有7,269人確診，死亡人數達170人，南投縣府自疫情曝光後就非常重視，會議中衛生局、教育處、社會及勞動處、新聞及行政處人員，分別就相關問題提出應對措施，縣內目前南投醫院、臺中榮總埔里分院及南投基督教醫院，皆設有負壓隔離病床及單人病室，竹山秀傳醫院、埔里基督教醫院也有隔離病床及單人病室，一旦發生狀況都可進行隔離。
國中小學將於2月11日開學，教育處也已要求學校加強健康管理措施，於開學前成立防疫小組，備妥適量的耳溫槍、洗手液及口罩，加強宣導衛生教育，確保學生健康。
社勞處除了積極訪視關心遊民，也要求社福及長照機構輔導長者與孩童勤洗手、戴口罩，暫時減少參加團體活動，有疑似症狀者立即通報縣府及防疫專線1922。
陳正昇指出此次會議召集各單位人員，就相關問題提出說明，並由疾管署中區分署解釋並提供意見，希望讓南投縣民生命財產多一重保障，同時感謝各單位同仁年節期間的辛勞。
衛生局長黃昭郎說，目前武漢肺炎冠狀病毒在流行期間，造成許多民眾搶購口罩，建議大家，有咳嗽、流鼻涕、咳嗽等上呼吸道症狀或發燒者，一定要戴上口罩，並到醫院就醫，前往醫院就醫或陪同者以及出入通風不良場所或密閉空間者，還有高齡者或慢性病者，因抵抗力較弱，也務必戴上口罩，確保自身健康。
